Cuttingenes
En producción · 3 nucleasas habilitadas · Validación reproducible

Diseña guías CRISPR con confianza

Plataforma de diseño de guías CRISPR. SpCas9, SaCas9 y Cas12a están disponibles comercialmente, con análisis off-target por pares para SpCas9. Cas13d está implementada pero deshabilitada hasta cerrar la licencia de su modelo.

🏢 Despliegue in-house disponible¿Privacidad o requisitos regulatorios? CuttinGenes puede desplegarse in-house, en tus propios servidores o cloud privado, sin exponer datos a terceros. Solicita información sobre licencias in-house institucionales. Próximamente: appliance hardware (instalación plug & play sin IT) para entornos farmacéuticos y hospitalarios.
3
nucleasas habilitadas
r=0.8499
Pearson SpCas9 DeepHF
hg38
Off-target con coordenadas reales
11
módulos de análisis

Nuevo en la app

Generador de protocolo lab: de guía validada a pedido de oligos en un clic

Incluye oligos pX330/pX458, primers PCR/Sanger y tamaño esperado de amplicón.

Probar protocolo

3 nucleasas habilitadas comercialmente

SpCas9, SaCas9 y Cas12a están disponibles; Cas13d permanece en investigación pendiente de licencia comercial. En Cas12a la puntuación es el percentil de actividad relativa entre guías de la misma diana, no un porcentaje de edición.

✂️

SpCas9

PAM: NGG

r = 0.8499
Pearson (DeepHF hold-out)
✂️

SaCas9

PAM: NNGRRT

r = 0.562
Pearson (Najm 2018, 293T)
✂️

Cas12a

PAM: TTTV

51 %
acierto mejor-de-3 (azar 33 %)

Todo lo que necesitas en una sola herramienta

De la secuencia al diseño experimental óptimo en menos de un segundo.

Predicción de eficiencia

XGBoost SpCas9 entrenado sobre DeepHF (Wang 2019, CC BY; más de 55.000 guías). Pearson r = 0.8499 en su hold-out propio.

🎯

Riesgo de off-target

Scoring SpCas9 por pareja guía-sitio (CFD, seed, mismatches, PAM) y búsqueda genómica real con Cas-OFFinder. No sustituye la validación experimental.

🔬

Multi-nucleasa

SpCas9, SaCas9 y Cas12a disponibles, las tres sobre datos con licencia comercial. Cas13d permanece deshabilitada mientras se negocia su licencia.

✏️

Edición base (CBE/ABE)

Predice eficiencia y riesgo bystander para editores de bases C→T y A→G. Análisis de ventana de actividad posición a posición.

🧬

Gen → Guías automático

Escribe BRCA1 o TP53 y obtén las mejores guías al instante desde Ensembl o NCBI, sin descargar ningún FASTA.

🔗

API REST + pagos Stripe

Integra en tus pipelines con API Keys. Actualiza de plan a Basic o Advanced directamente desde la app con pago seguro via Stripe.

11 módulos de análisis integrados

Todo en la misma interfaz. Sin necesidad de cambiar de herramienta.

🧬

Predicción de secuencias

Analiza una o varias guías (20 nt): eficiencia, off-target, CrisprScore y características moleculares.

📊

Predicción en lote (CSV)

Sube un CSV con cientos de guías y obtén predicciones para todas en segundos.

🔬

Escaneo PAM / FASTA

Sube un FASTA y obtén guías candidatas con eficacia on-target; el scoring off-target está disponible para SpCas9.

⚖️

Comparar guías

Visualiza y compara múltiples guías lado a lado con gráficas interactivas.

📋

Formatear CSV

Limpia y normaliza archivos CSV de cualquier formato para prepararlos para predicción.

Validación experimental

Compara predicciones con tus datos experimentales y calcula métricas de rendimiento (Pearson, Spearman, AUC).

🕐

Historial

Accede a todas tus predicciones anteriores y descárgalas en cualquier momento.

🔬

Escaneo multi-nucleasa

Escanea un FASTA con SpCas9, SaCas9 o Cas12a y filtra por eficacia on-target. Cas13d se habilitará al cerrar su licencia.

✏️

Edición base (CBE / ABE)

Predice eficiencia y riesgo bystander para editores C→T y A→G con análisis ventana posición a posición.

🧬

Gen → Guías automático

Escribe BRCA1 o TP53 y obtén las mejores guías desde Ensembl o NCBI sin descargar ningún archivo.

🧪

Protocolo de laboratorio

Genera oligos de clonación (pX330/pX458), primers PCR/Sanger y tamaño esperado de amplicón para pasar de diseño a bench en un clic.

🤖 Asistente IA integrado

Dilo con tus palabras y el formulario se rellena solo

Un asistente conversacional dentro de la app. Describe lo que necesitas y abre la pestaña correcta con los campos ya puestos. Entiende español e inglés.

🔒

Tus datos no salen del servidor

Sin API externas ni llamadas a terceros: todo el procesamiento ocurre en la instalación donde corre la aplicación, incluso el modelo de lenguaje en los despliegues que lo incluyen.

Propone, no ejecuta

Prepara el formulario y se detiene ahí. Tú revisas los valores y pulsas el botón: ninguna frase suya lanza un análisis ni consume cuota.

📎

Acepta tus ficheros

Arrastra un FASTA o un CSV al chat y lo coloca en la pestaña que corresponde. El fichero se queda en tu navegador hasta que lo ejecutas.

🧬

No se inventa secuencias

Cualquier guía que aparezca en un campo la has escrito tú. Si le pides un ejemplo, usa guías publicadas y te avisa de que lo son.

🤖Asistente IA integrado
guías de BRCA1 en humano con SaCas9
He abierto Gen → Guías y he rellenado Nucleasa = SaCas9, Especie = human, Nombre del gen = BRCA1.
🏆 Validado externamente frente a herramientas publicadas

Rendimiento validado en datasets independientes

SpCas9 evaluado sobre datos nunca vistos durante el entrenamiento. Comparable a las mejores herramientas del estado del arte.

#2 de 6
Ranking Labuhn 2018
Frente a Doench2016, CHOPCHOP, CRISPRscan, sgRNA Designer y FlashFry
r = 0.276
Validación externa Labuhn
Pearson en 476 guías del dataset Labuhn 2018 (independiente del entrenamiento)
r = 0.275
Validación externa Xu 2015
Pearson en 2,069 guías del dataset Xu 2015 (independiente del entrenamiento)

¿Cómo funciona?

01

Elige tu entrada

Pega una secuencia de 20 nt, sube un CSV, escribe el nombre del gen (BRCA1, TP53) o sube un FASTA. La herramienta se adapta a tu flujo.

02

Elige nucleasa y editor

SpCas9 por defecto. Cambia a SaCas9 o Cas12a. Activa edición base (CBE/ABE) si necesitas cambios puntuales sin romper el ADN.

03

Obtén resultados y exporta

Consulta eficacia, posición y hebra; en los flujos SpCas9 compatibles, añade scoring off-target y CrisprScore. Ordena y exporta a CSV.

💡 ¿Buscas algo que no ves?

Cuéntanos qué necesitas de una herramienta CRISPR

Si tu equipo necesita una función, nucleasa o integración que no ves aquí, describe tu caso. Lo revisamos y te contactamos para entenderlo mejor. No es una promesa de función: es el inicio de una conversación.

Empieza gratis hoy

El plan Free incluye 50 predicciones al mes sin tarjeta de crédito. Para laboratorios e instituciones, licencias desde 3.000 €/año con predicciones ilimitadas y API.